長い、苦しい取り調べうけたシーボルトでしたが、日本を追放されたのち、持ち帰った地理（ちり）と地図に関する書類は160種類にもなりました。その中には、蝦夷や樺太（えぞやからふと）の地図と多くの日本各地の国絵図（くにえず）や、忠敬の日本全図の写（うつ）しもふくまれていました。
　帰国後シーボルトは、それらの地図などをもとに、「日本図」を初め「長崎湾の図」、「蝦夷地地図」、「朝鮮半島の地図」などのたくさんの地図を発行しました。
　
　とくにシーボルトの代表作である、「日本」という本の中で、伊能忠敬と間宮林蔵の地図がせいかくであること、彼が、間宮の瀬戸（まみやのせと：間宮海峡のこと）を発見したことを、しょうかいしています。また、ここにしょうかいされた「日本全図」から、伊能忠敬らの測量技術（そくりょうぎじゅつ）と日本地図のせいかくさが世界中にみとめられました。
　
　一度は幕府役人につかまったシーボルトが、さらにこっそりと持ち帰った地図などによって、日本の地図がせいかくであるとみとめられたのは、おもしろいことです。
　その後1858年、日本とオランダの通商条約（つうしょうじょうやく）がむすばれ、シーボルトの罪（つみ）もゆるされたので、30年ぶりに日本に来ました（1859年）。